Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fscn3Q9QXW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms