Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Fscn3Q9QXW4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Fscn3Q9QXW4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fscn3Q9QXW4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Fscn3Q9QXW4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fscn3Q9QXW4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Fscn3Q9QXW4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Fscn3Q9QXW4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fscn3Q9QXW4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fscn3Q9QXW4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fscn3Q9QXW4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fscn3Q9QXW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fscn3Q9QXW4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fscn3Q9QXW4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fscn3Q9QXW4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fscn3Q9QXW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fscn3Q9QXW4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fscn3Q9QXW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fscn3Q9QXW4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fscn3Q9QXW4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fscn3Q9QXW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fscn3Q9QXW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fscn3Q9QXW4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fscn3Q9QXW4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fscn3Q9QXW4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fscn3Q9QXW4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fscn3Q9QXW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fscn3Q9QXW4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fscn3Q9QXW4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fscn3Q9QXW4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fscn3Q9QXW4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fscn3Q9QXW4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fscn3Q9QXW4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fscn3Q9QXW4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Fscn3Q9QXW4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fscn3Q9QXW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fscn3Q9QXW4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fscn3Q9QXW4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fscn3Q9QXW4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fscn3Q9QXW4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fscn3Q9QXW4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fscn3Q9QXW4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fscn3Q9QXW4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fscn3Q9QXW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fscn3Q9QXW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fscn3Q9QXW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fscn3Q9QXW4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fscn3Q9QXW4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fscn3Q9QXW4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fscn3Q9QXW4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fscn3Q9QXW4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fscn3Q9QXW4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fscn3Q9QXW4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fscn3Q9QXW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fscn3Q9QXW4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fscn3Q9QXW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fscn3Q9QXW4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fscn3Q9QXW4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fscn3Q9QXW4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fscn3Q9QXW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fscn3Q9QXW4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fscn3Q9QXW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fscn3Q9QXW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fscn3Q9QXW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fscn3Q9QXW4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fscn3Q9QXW4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fscn3Q9QXW4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fscn3Q9QXW4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fscn3Q9QXW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fscn3Q9QXW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fscn3Q9QXW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fscn3Q9QXW4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fscn3Q9QXW4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fscn3Q9QXW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fscn3Q9QXW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fscn3Q9QXW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fscn3Q9QXW4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fscn3Q9QXW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fscn3Q9QXW4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fscn3Q9QXW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fscn3Q9QXW4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fscn3Q9QXW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fscn3Q9QXW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fscn3Q9QXW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fscn3Q9QXW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fscn3Q9QXW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fscn3Q9QXW4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fscn3Q9QXW4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fscn3Q9QXW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms