Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dpf1Q9QX66 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dpf1Q9QX66 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dpf1Q9QX66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dpf1Q9QX66 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dpf1Q9QX66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms