Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyth1Q9QX11 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyth1Q9QX11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyth1Q9QX11 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyth1Q9QX11 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms