Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYY8

FASTKD2, FAST kinase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FASTKD2Q9NYY8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 31.2
FASTKD2Q9NYY8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 31.2
FASTKD2Q9NYY8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 31.2
FASTKD2Q9NYY8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 223.24■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.741e-323■■■■■ 31.1
FASTKD2Q9NYY8 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 523.78■■□□□ 1.48e-44■■■■■ 31
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 318.8■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-203ENST00000587752 683 ntTSL 515.53■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 CTIF-210ENST00000591412 491 ntTSL 313.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 218.64■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 30.9
FASTKD2Q9NYY8 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 518.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 30.8
FASTKD2Q9NYY8 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.034e-8■■■■■ 30.8
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 421.52■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 421.52■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 221.52■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 421.52■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 421.52■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 419.99■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 517.36■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 415.21■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.038e-44■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.138e-44■■■■■ 30.7
FASTKD2Q9NYY8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.562e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.474e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 321.11■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.97■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 TRIM8-204ENST00000487927 761 ntTSL 320.8■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 220.59■□□□□ 0.892e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 219.69■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 219.54■□□□□ 0.722e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 LINC01770-204ENST00000454562 424 ntTSL 318.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 POLR2H-209ENST00000460083 439 ntTSL 316.85■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 513.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 29.93□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-22■■■■■ 30.6
FASTKD2Q9NYY8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 30.5
FASTKD2Q9NYY8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 30.5
FASTKD2Q9NYY8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 30.5
FASTKD2Q9NYY8 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 324.93■■□□□ 1.584e-7■■■■■ 30.5
FASTKD2Q9NYY8 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 416.27■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30.5
FASTKD2Q9NYY8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-14■■■■■ 30.4
FASTKD2Q9NYY8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-14■■■■■ 30.4
FASTKD2Q9NYY8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-14■■■■■ 30.4
FASTKD2Q9NYY8 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 30.4
FASTKD2Q9NYY8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.348e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 423.38■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 223.38■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.198e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 422.15■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 522.15■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 521.71■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 521.27■■□□□ 18e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.998e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 220.57■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 219.22■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 419.12■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 315.5■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 312.31□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 39.54□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 30.3
FASTKD2Q9NYY8 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 523.28■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 30.2
FASTKD2Q9NYY8 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 214.78□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 30.2
FASTKD2Q9NYY8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 30.1
FASTKD2Q9NYY8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 30.1
FASTKD2Q9NYY8 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 30.1
FASTKD2Q9NYY8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.1
FASTKD2Q9NYY8 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.1
FASTKD2Q9NYY8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 29.9
FASTKD2Q9NYY8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 29.9
FASTKD2Q9NYY8 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 9,514 protein–RNA pairs in 419 ms