Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FliiQ9JJ28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FliiQ9JJ28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FliiQ9JJ28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FliiQ9JJ28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms