Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Elp3Q9CZX0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Elp3Q9CZX0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Elp3Q9CZX0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms