Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Bud23Q9CY21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bud23Q9CY21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms