Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2Q9CQP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2Q9CQP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms