Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp3Q9CQ10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp3Q9CQ10 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
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