Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe41Q99PV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms