Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntnap4Q99P47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap4Q99P47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap4Q99P47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms