Protein–RNA interactions for Protein: Q99N19

Cyp4f13, Cytochrome P450 CYP4F13, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f13Q99N19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp4f13Q99N19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f13Q99N19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f13Q99N19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f13Q99N19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms