Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atad3Q925I1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atad3Q925I1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms