Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt5Q922U2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt5Q922U2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt5Q922U2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms