Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps4aQ8VEJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps4aQ8VEJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms