Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shtn1Q8K2Q9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Shtn1Q8K2Q9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shtn1Q8K2Q9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Shtn1Q8K2Q9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shtn1Q8K2Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shtn1Q8K2Q9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms