Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Commd9Q8K2Q0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd9Q8K2Q0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd9Q8K2Q0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd9Q8K2Q0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms