Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Glis1Q8K1M4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Glis1Q8K1M4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Glis1Q8K1M4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Glis1Q8K1M4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms