Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne4Q8CII8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syne4Q8CII8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne4Q8CII8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syne4Q8CII8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms