Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx30Q8CE50 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snx30Q8CE50 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx30Q8CE50 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms