Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9E8

Calhm6, Calcium homeostasis modulator protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm6Q8C9E8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calhm6Q8C9E8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calhm6Q8C9E8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calhm6Q8C9E8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calhm6Q8C9E8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calhm6Q8C9E8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms