Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1A5

Thop1, Thimet oligopeptidase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thop1Q8C1A5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thop1Q8C1A5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thop1Q8C1A5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thop1Q8C1A5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thop1Q8C1A5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms