Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad3Q8BUN5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad3Q8BUN5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smad3Q8BUN5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad3Q8BUN5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms