Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snapc4Q8BP86 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snapc4Q8BP86 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snapc4Q8BP86 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snapc4Q8BP86 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Snapc4Q8BP86 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms