Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPS2

Carns1, Carnosine synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carns1Q6ZPS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Carns1Q6ZPS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Carns1Q6ZPS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Carns1Q6ZPS2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Carns1Q6ZPS2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms