Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc9c1Q6UJY2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9c1Q6UJY2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc9c1Q6UJY2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms