Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krba1Q6NXZ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krba1Q6NXZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krba1Q6NXZ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krba1Q6NXZ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms