Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SphkapQ6NSW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SphkapQ6NSW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SphkapQ6NSW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SphkapQ6NSW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SphkapQ6NSW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms