Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AcanQ61282 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AcanQ61282 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AcanQ61282 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AcanQ61282 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AcanQ61282 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AcanQ61282 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AcanQ61282 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AcanQ61282 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms