Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl17Q5UW37 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcl17Q5UW37 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl17Q5UW37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms