Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psme4Q5SSW2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme4Q5SSW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme4Q5SSW2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms