Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms