Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Spag9Q58A65 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Spag9Q58A65 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Spag9Q58A65 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Spag9Q58A65 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Spag9Q58A65 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spag9Q58A65 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms