Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne3Q4FZC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne3Q4FZC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne3Q4FZC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms