Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shank3Q4ACU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shank3Q4ACU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Shank3Q4ACU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shank3Q4ACU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms