Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc43Q3V0L5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc43Q3V0L5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc43Q3V0L5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lrrc43Q3V0L5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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