Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D130052B06RikQ3UW13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms