Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hhla1Q3TYV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hhla1Q3TYV2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hhla1Q3TYV2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms