Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc28Q3TX51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc28Q3TX51 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc28Q3TX51 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms