Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
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Shroom4Q1W617 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Shroom4Q1W617 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom4Q1W617 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
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Shroom4Q1W617 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Shroom4Q1W617 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Shroom4Q1W617 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
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