Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa6Q0VGU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bpifa6Q0VGU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bpifa6Q0VGU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms