Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 TUF1YOR187W 1314 nt5.99□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 MRPL28YDR462W 444 nt5.99□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 RPL31BYLR406C 342 nt5.99□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 CEM1YER061C 1329 nt5.99□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 SSC1YJR045C 1965 nt5.98□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 FCY22YER060W-A 1593 nt5.98□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 MRPL35YDR322W 1104 nt5.98□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 MRPS28YDR337W 861 nt5.98□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 MSC3YLR219W 2187 nt5.98□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 GGC1YDL198C 903 nt5.97□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 MCH2YKL221W 1422 nt5.97□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 FMP40YPL222W 2067 nt5.97□□□□□ -1.45
NIP7Q08962 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 SWD1YAR003W 1281 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 ARC35YNR035C 1029 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 TMA46YOR091W 1038 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YOR111WYOR111W 699 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 FCP1YMR277W 2199 nt5.96□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 PAC10YGR078C 600 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 CTF3YLR381W 2202 nt5.95□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 PAC2YER007W 1557 nt5.94□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YDL177CYDL177C 513 nt5.94□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 HED1YDR014W-A 489 nt5.94□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 URH1YDR400W 1023 nt5.94□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 ERS1YCR075C 783 nt5.93□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YSC83YHR017W 1158 nt5.93□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 CBR1YIL043C 855 nt5.93□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 ASF1YJL115W 840 nt5.93□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 SEC62YPL094C 825 nt5.92□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 CRH1YGR189C 1524 nt5.92□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YEL023CYEL023C 2049 nt5.92□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 PPM2YOL141W 2088 nt5.92□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YBR241CYBR241C 1467 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 AFG2YLR397C 2343 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 LCL3YGL085W 825 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RPL2BYIL018W 765 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 ATG36YJL185C 882 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 RNH1YMR234W 1047 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 TAF9YMR236W 474 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 HBN1YCL026C-B 582 nt5.91□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 TAH11YJR046W 1815 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 NUP84YDL116W 2181 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YJL045WYJL045W 1905 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 TRS31YDR472W 852 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 FMO1YHR176W 1299 nt5.9□□□□□ -1.46
NIP7Q08962 YHR020WYHR020W 2067 nt5.9□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 ECM27YJR106W 2178 nt5.9□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YHR131CYHR131C 2553 nt5.89□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 CYB2YML054C 1776 nt5.89□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt5.89□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 MRPS18YNL306W 654 nt5.89□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YIL108WYIL108W 2091 nt5.89□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 HHY1YEL059W 309 nt5.88□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YKL102CYKL102C 306 nt5.88□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YNL092WYNL092W 1203 nt5.88□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 LSC1YOR142W 990 nt5.88□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YHK8YHR048W 1545 nt5.88□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 GUT1YHL032C 2130 nt5.87□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YBR113WYBR113W 483 nt5.87□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 DOT1YDR440W 1749 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 SAL1YNL083W 1485 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 COQ1YBR003W 1422 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 COX10YPL172C 1389 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 RGD2YFL047W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 CBK1YNL161W 2271 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 IMG1YCR046C 510 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 STF1YDL130W-A 261 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 GCG1YER163C 699 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YRB2YIL063C 984 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 GCN3YKR026C 918 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 IRC11YOR013W 471 nt5.85□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 PRY3YJL078C 2646 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 NTG1YAL015C 1200 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YKL077WYKL077W 1179 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 YAR064WYAR064W 300 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 ILV6YCL009C 930 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 CCT3YJL014W 1605 nt5.84□□□□□ -1.47
NIP7Q08962 AIM20YIL158W 615 nt5.83□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 COX16YJL003W 357 nt5.83□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 MGM101YJR144W 810 nt5.83□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 SRF1YDL133W 1314 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.82□□□□□ -1.48
NIP7Q08962 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.82□□□□□ -1.48
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