Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkacbP68181 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkacbP68181 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacbP68181 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms