Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad23bP54728 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rad23bP54728 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad23bP54728 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad23bP54728 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms