Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux1P53564 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux1P53564 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux1P53564 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux1P53564 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux1P53564 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux1P53564 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux1P53564 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux1P53564 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux1P53564 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cux1P53564 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cux1P53564 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux1P53564 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux1P53564 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux1P53564 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux1P53564 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cux1P53564 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux1P53564 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux1P53564 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms