Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 RRN10YBL025W 438 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF2P53277 HBN1YCL026C-B 582 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF2P53277 REC107YJR021C 945 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YJR154WYJR154W 1041 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF2P53277 ARC35YNR035C 1029 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF2P53277 RGD2YFL047W 2145 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 TUF1YOR187W 1314 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YLL066CYLL066C 3618 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 PRE5YMR314W 705 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YNR005CYNR005C 405 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 VBA5YKR105C 1749 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF2P53277 UBP13YBL067C 2244 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF2P53277 RPL31BYLR406C 342 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YNR014WYNR014W 639 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YBR241CYBR241C 1467 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YLR162WYLR162W 357 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF2P53277 ZIM17YNL310C 525 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF2P53277 LAT1YNL071W 1449 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF2P53277 CBR1YIL043C 855 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF2P53277 VTS1YOR359W 1572 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF2P53277 MRPS28YDR337W 861 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF2P53277 URH1YDR400W 1023 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF2P53277 SMK1YPR054W 1167 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF2P53277 MFG1YDL233W 1377 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF2P53277 YSC83YHR017W 1158 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF2P53277 RPL2BYIL018W 765 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF2P53277 MGM101YJR144W 810 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF2P53277 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 YOX1YML027W 1158 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 SML1YML058W 315 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF2P53277 ERG12YMR208W 1332 nt6.25□□□□□ -1.41
SYF2P53277 ACO1YLR304C 2337 nt6.25□□□□□ -1.41
SYF2P53277 MSC3YLR219W 2187 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 YJL163CYJL163C 1668 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 PPH22YDL188C 1134 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 PTC7YHR076W 1032 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 PRI1YIR008C 1230 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 FIT2YOR382W 462 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 ICP55YER078C 1536 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 NUP49YGL172W 1419 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 CMK2YOL016C 1344 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF2P53277 EMP65YER140W 1671 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF2P53277 AIM46YHR199C 933 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF2P53277 IRC11YOR013W 471 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF2P53277 SEC62YPL094C 825 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF2P53277 YPL247CYPL247C 1572 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF2P53277 PEX31YGR004W 1389 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 CLN1YMR199W 1641 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 HEM2YGL040C 1029 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 COX16YJL003W 357 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 YOL046CYOL046C 675 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 SMX3YPR182W 261 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF2P53277 YPR204WYPR204W 3099 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YDL177CYDL177C 513 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YGL102CYGL102C 429 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 DYS1YHR068W 1164 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 DOT1YDR440W 1749 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF2P53277 STT3YGL022W 2157 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF2P53277 ERG10YPL028W 1197 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF2P53277 MLS1YNL117W 1665 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF2P53277 SKY1YMR216C 2229 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF2P53277 FCY22YER060W-A 1593 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YMR034CYMR034C 1305 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF2P53277 RSP5YER125W 2430 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 OPI8YKR035C 642 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 MCP1YOR228C 909 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 DFR1YOR236W 636 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 RPL5YPL131W 894 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 OPI11YPR044C 354 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YHR020WYHR020W 2067 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF2P53277 HEL1YKR017C 1656 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 ECM38YLR299W 1983 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 CTF8YHR191C 402 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 YKL077WYKL077W 1179 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 DID2YKR035W-A 615 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 ECM30YLR436C 3825 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 BDF2YDL070W 1917 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF2P53277 COQ1YBR003W 1422 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF2P53277 MPH3YJR160C 1809 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF2P53277 AGX1YFL030W 1158 nt6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69 ms