Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp1P52624 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp1P52624 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp1P52624 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp1P52624 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp1P52624 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp1P52624 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upp1P52624 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upp1P52624 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp1P52624 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp1P52624 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upp1P52624 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Upp1P52624 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upp1P52624 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms