Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmod1P49813 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmod1P49813 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmod1P49813 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms