Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PcntP48725 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PcntP48725 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PcntP48725 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PcntP48725 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PcntP48725 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PcntP48725 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PcntP48725 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcntP48725 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcntP48725 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcntP48725 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcntP48725 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcntP48725 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PcntP48725 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PcntP48725 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PcntP48725 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PcntP48725 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PcntP48725 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PcntP48725 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PcntP48725 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PcntP48725 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PcntP48725 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PcntP48725 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PcntP48725 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PcntP48725 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PcntP48725 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PcntP48725 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PcntP48725 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PcntP48725 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PcntP48725 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcntP48725 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcntP48725 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcntP48725 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcntP48725 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PcntP48725 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PcntP48725 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PcntP48725 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PcntP48725 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcntP48725 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcntP48725 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PcntP48725 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PcntP48725 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PcntP48725 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PcntP48725 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PcntP48725 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PcntP48725 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcntP48725 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PcntP48725 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PcntP48725 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PcntP48725 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PcntP48725 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PcntP48725 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PcntP48725 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PcntP48725 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PcntP48725 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PcntP48725 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PcntP48725 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PcntP48725 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcntP48725 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcntP48725 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcntP48725 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcntP48725 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcntP48725 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms